Frontiers in Microbiology

David Ríos-Covián, Patricia Ruas-Madiedo, Abelardo Margolles, Miguel Gueimonde, Clara G. de los Reyes-Gavilán, Nuria Salazar*

本文系统综述了肠道短链脂肪酸（SCFA）的生物合成机制（涵盖细菌间的交叉喂养效应），阐释了饮食模式对其生成的调控作用，并深入剖析了该类代谢产物在塑造肠道微环境、作为能量底物及参与宿主信号传导等方面对人体生理健康的关键影响。

Gregory B. Gloor*, Jean M. Macklaim, Vera Pawlowsky-Glahn, Juan J. Egozcue

本文旨在阐明高通量测序微生物组数据的成分数据（compositional data）本质，剖析了忽略该特征可能导致的统计学谬误（pathologies），并为在数据分析全流程中规范应用成分数据分析（CoDA）方法提供了理论依据与实践指引。

Kaiyang Qu, Fei Guo, Xiangrong Liu, Yuan Lin, Quan Zou*

本文系统综述了机器学习（ML）技术在微生物学领域的应用现状，重点阐述了该技术在克服传统培养法局限、解决微生物分类难题及解析微生物与环境相互作用机制方面的关键作用与研究进展。

Dan Coursolle, Jeffrey A. Gralnick*

本文通过在 Shewanella oneidensis MR-1 中系统重构并功能验证了 Mtr 呼吸途径的多种同源蛋白（Paralog）组合，揭示了特定同源复合物（如含 MtrE 的组合）在胞外铁（III）还原过程中的功能活性与特异性，为理解厌氧呼吸系统的进化机制及优化生物修复与生物产电技术提供了分子生物学基础。

Qinghui Mu, Vincent J. Tavella, Xin M. Luo*

本文系统阐述了益生菌罗伊氏乳杆菌（Lactobacillus reuteri）通过分泌抗菌代谢物、调节免疫耐受（如促进调节性T细胞发育）及增强肠道屏障功能等多重机制改善宿主健康的生理基础，并论证了其在缓解微生物移位（microbial translocation）及防治炎症性疾病方面的临床应用潜力。

Xingjian Xu, Wenming Liu, Shuhua Tian, Wei Wang, Qige Qi, Pan Jiang, Xinmei Gao, Fengjiao Li, Haiyan Li, Hongwen Yu*

本文综述了利用石油烃降解菌在有氧条件下进行生物修复的最新研究进展，重点剖析了限制该技术大规模实际应用的环境制约因素与实施壁垒，并为未来的技术优化与发展方向提出了前瞻性建议。